Een groep Amerikaanse wetenschappers heeft een laboratoriumtest ontwikkeld waarmee snel kan worden vastgesteld welke variant van het coronavirus iemand heeft besmet die positief test op COVID-19. De test kan gezondheidsambtenaren helpen de pandemie gemakkelijker op te sporen en artsen helpen patiënten doeltreffender te behandelen.
Wetenschappers ontwikkelen test om snel COVID-19-varianten te identificeren
Door Carolyn Crist
6 mei 2022 -- Een groep Amerikaanse wetenschappers heeft een laboratoriumtest ontwikkeld die snel kan identificeren welke variant van het coronavirus iemand heeft geïnfecteerd die positief test op COVID-19, volgens een recent rapport gepubliceerd in The Journal of Molecular Diagnostics.
De test, die alle huidige en mogelijk toekomstige zorgwekkende varianten kan identificeren, zou gezondheidsambtenaren kunnen helpen de pandemie gemakkelijker op te sporen en artsen kunnen helpen patiënten doeltreffender te behandelen.
We waren in staat om een PCR-test te maken, net als die in een normale COVID-19 diagnose, die niet alleen het SARS-CoV-2 virus detecteert, maar ook identificeert welke variant aanwezig is, zei Ryan Dikdan, de hoofdauteur van de studie en een doctoraalstudent volksgezondheid aan de Rutgers University, in een verklaring.
Dit is belangrijk omdat we nu de varianten kunnen identificeren zoals ze opduiken in elk monster, zeer snel, zei hij.
PCR-tests maken gebruik van een techniek die bekend staat als de polymerase kettingreactie, die wetenschappers in staat stelt om een klein monster van DNA te nemen en het te amplificeren tot een hoeveelheid die groot genoeg is om te bestuderen.
De meeste huidige PCR-tests voor COVID-19 detecteren alleen de aanwezigheid van het coronavirus en identificeren niet een bepaalde stam van het virus. Volksgezondheidsfunctionarissen hebben geworsteld met het opsporen van de verschillende varianten tijdens de pandemie, waarbij onderzoekers fysieke monsters moesten nemen en een ingewikkeld genetisch sequentieproces moesten uitvoeren.
De nieuwe test maakt gebruik van moleculaire beacon-technologie, waarbij microscopische sondes worden gebruikt om moleculen op te sporen die genetische informatie dragen om eiwitten te maken. De probes zijn zo nauwkeurig dat zij onderscheid kunnen maken tussen verschillende doelwitten in de gensequentie die slechts één chemische base van elkaar verschillen. Zodra de sondes het doelwit hebben gevonden, worden ze fluorescerend en fungeren ze als baken. Aan de hand van die informatie kunnen wetenschappers de coronavirusstam bepalen.
De Rutgers-test kan acht verschillende mutaties opsporen op het spike-eiwit dat het coronavirus gebruikt om menselijke cellen aan te vallen. De acht mutaties zijn geïdentificeerd in de huidige zorgwekkende varianten en zijn veel voorkomende mutaties die de overdraagbaarheid van het virus vergroten en aan immuniteit ontsnappen. Dat betekent dat de test in de toekomst waarschijnlijk doeltreffend zal zijn voor het opsporen van nieuwe varianten die een combinatie van deze mutaties gebruiken.
Rutgers-onderzoekers willen de technologie gratis delen met andere laboratoria en testbedrijven, zodat informatie over varianten gemakkelijk beschikbaar is.
Aangezien PCR-machines nu bijna net zo gewoon zijn als koffiezetapparaten, kan stamtypering overal worden gedaan zonder gevallen te missen, zei Sanjay Tyagi, de senior auteur van de studie en een professor in de geneeskunde aan Rutgers, in de verklaring.
De test zal een meer accurate behandeling van ernstige COVID mogelijk maken, aangezien een snelle PCR-test om de varianten te identificeren nu kan worden uitgevoerd in de lokale ziekenhuisomgeving, zei hij.
